В дебелото черво живеят над един милиард живи микроорганизми, които заедно съставят микробиома (микрофлората) на човешкото тяло. Всеки човек има свой собствен микробиом, представляващ множество най-различни микроорганизми. На всяка човешка клетка се падат десет бактериални клетки, на всеки ген - 100 бактериални гени. Първите бактерии попадат в организма на новороденото още в родилния канал, като бактериалната общност остава в тялото до края на човешкия живот. Променя се само съставът на бактериите.